1.调试期故障
(1)管道系统和安装等方面
通常故障是由于电磁流量传感器安装位置不正确造成的，如在管网高点安装流量传感器，容易积聚滞留气体；流量传感器后面没有背压，液体直接排入大气，在其测量管内形成非满管；当从上到下安装在垂直管道上时，可能会发生排空。
(2)环境方面
主要是管道杂散电流干扰、空间电磁波干扰、大电机磁场干扰等。单独采用良好的接地保护，可以令人满意地测量管道的杂散电流干扰，但当管道(如电解车间的管道)中出现强杂散电流时，可能无法克服，因此应采取措施将流量传感器与管道分开。
(3)流体方面
液态包含均匀分布的细小气泡一般不影响正常测量，只是体积流量为液态和气体之和；气泡增大会使输出信号产生波动，如果气泡增大到流过电极覆盖的整个表面，则导致电极信号回路瞬时断开，而输出信号则产生较大波动。低频率(50/16hz-50/6 Hz)矩形波激磁电磁流量计在测量液体中的固态物质含量超过某一含量时，会产生浆液噪声，使输出信号产生一定的波动。
2.运行期故障
(1)内壁附着层
因为与其它流量计相比，电磁流量计测量悬浮固体和污垢的机会要大得多，所以发生内壁附着看层故障的几率也比较高。如果附着层电导率接近于液体电导率，仪表也可以正常输出信号，仅仅是改变了流通区域，形成测量误差的隐性故障；如果附着层较高，则电极间电动势会发生短路；如果附着层绝缘，则电极表面绝缘，并断开测量电路。这两种现象都会使仪表失效。
(2)电击雷。
雷击在线路中感应出瞬间的高电压和浪涌电流，进入仪器时会损坏仪器。介绍雷损仪有三种方式:电源线、传感器勺转换器与励磁线之间的流量信号线。
